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糖組學(xué)是繼基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)后生命科學(xué)的新興研究領(lǐng)域.其主要研究內(nèi)容為:寡糖的空間結(jié)構(gòu)及其在生物機體中所發(fā)揮的功能.寡糖作為一種重要的碳水化合物,參與蛋白質(zhì)折疊和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等多種細(xì)胞生命過程,同時,它經(jīng)常與蛋白質(zhì)和脂類化合物結(jié)合在一起形成糖蛋白和糖脂.

寡糖通常由多個單糖通過糖苷鍵連接而成,并呈現(xiàn)出樹形的分枝結(jié)構(gòu).因此,寡糖結(jié)構(gòu)的解析是一個包括對糖類分子組成、單糖的連接順序和連接位點依 次逐層解 的過 程. 1 示出了 N GlcNAc2Man9 結(jié)構(gòu)的多種經(jīng)典表示方式,雖然表示方式不同,但它們都是以樹形結(jié)構(gòu)呈現(xiàn),每一樹形結(jié)構(gòu)根節(jié)點位于結(jié)構(gòu)的最右邊,子節(jié)點向左逐步延伸,每一個節(jié)點代表一個單糖,每一條邊代表連接 2 個單糖的糖

苷鍵,數(shù)字代表寡糖結(jié)構(gòu)中單糖之間的連接位點,琢、茁 是指通過半縮醛形成六元環(huán)的結(jié)構(gòu)時羥基的相對位置.寡糖的樹形結(jié)構(gòu)增加了寡糖結(jié)構(gòu)的解析難度.圖 2 示出了寡糖結(jié)構(gòu)中 2 個單糖之間通過糖苷鍵連接的表示方式,每一個單糖通過糖苷鍵可以跟另外一個或多個單糖相連接形成如同樹形的分枝結(jié)構(gòu),這種分枝結(jié)構(gòu)的復(fù)雜性導(dǎo)致了寡糖結(jié)構(gòu)的多樣性。

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廣靶靶向寡糖組學(xué)分析包括糖組學(xué)實驗及糖組學(xué)數(shù)據(jù)分析兩大部分,其中數(shù)據(jù)分析主要包括差異寡糖物質(zhì)篩選及寡糖結(jié)構(gòu)解析?;趯嶒炘O(shè)計、樣本的采集及處理、寡糖物質(zhì)提取以及寡糖物質(zhì)的檢測分析獲取寡糖組學(xué)的數(shù)據(jù),可以進(jìn)行寡糖物質(zhì)的鑒定與樣本數(shù)據(jù)的質(zhì)控分析,并篩選出一些有差異的寡糖物質(zhì),從而對樣本的寡糖物質(zhì)進(jìn)行相關(guān)的功能預(yù)測和分析。 本項目基于UPLC LTQ-

Orbitrap MS/MS velos平臺,對寡糖樣本陽離子模式下的質(zhì)譜數(shù)據(jù),進(jìn)行寡糖組學(xué)定性定量分析。

博睿糖寡糖庫(BRT-carbohydrate libary),經(jīng)過8年積累,寡糖數(shù)據(jù)庫約900多種,打譜構(gòu)建的寡糖庫,覆蓋大量植物寡糖類,如半乳寡糖,甘露寡糖,葡甘露寡糖,半乳甘露寡糖,阿拉伯寡糖,木寡糖,阿拉伯木寡糖,支鏈淀粉寡糖,直鏈淀粉寡糖,木葡寡糖。

實驗流程


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實驗結(jié)果有三部分組成:第一 定性表,第二是定量表,第三是原始數(shù)據(jù)。如果做寡糖指紋圖譜的話,也有對應(yīng)的對比的報告。

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 參考文獻(xiàn):串聯(lián)質(zhì)譜寡糖結(jié)構(gòu)解析方法評介。


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